Agencija za identifikacione dokumente, evidenciju i razmjenu podataka Bosne i Hercegovine od 2009. godine koristi biometrijske sisteme u procesima izdavanja biometrijskih putnih dokumenata u okviru svoje nadležnosti.

Biometrijski sistem koji se koristi u Agenciji je veoma dostupan i performantan, te osim osnovne namjene koja podrazumijeva verifikaciju identiteta podnosioca zahtjeva za biometrijski dokument, omogućuje i napredne tehnike prepoznavanja i pronalaženja podudarnosti lica i otisaka upoređujući ih sa biometrijskim podacima u nadležnosti Agencije.

Sve funkcionalnosti biometrijskog sistema Agencije su preko odgovarajućih softverskih rješenja dostupne policijskim agencijama u Bosni i Hercegovini.

Također, u toku je realizacija pilot projekta Centralne izborne komisije Bosne i Hercegovine kojeg finansira  Delegacija Evropske unije čiji je cilj identifikacija birača pomoću otiska prsta korištenjem  biometrijskog sistem Agencije.